Bioinformatica
Dalla sequenza alla struttura delle proteine
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Informazioni su questo libro
Il connubio tra biologia e informatica potrebbe apparire, in un primo momento, curioso. In realtà, la vita stessa può essere interpretata come un flusso continuo d'informazione, conservata attraverso il codice genetico e capace di plasmare la materia biologica nelle funzioni e nelle forme più svariate.La bioinformatica, la disciplina che applica i principi della scienza dell'informazione alla biologia per rendere più comprensibile il complesso mondo delle scienze della vita, opera principalmente in tre ambiti: - la conservazione, l'organizzazione e la distribuzione di dati relativi agli esseri viventi;- lo sviluppo di metodologie e l'implementazione di algoritmi per l'indagine in campo biomedico;- l'utilizzo di tali strumenti per estrapolare informazione dai dati.Questo manuale propone una panoramica delle tecniche bioinformatiche utili per affrontare l'analisi di proteine (bioinformatica strutturale), introduce lo studente alla logica di funzionamento dei programmi più usati e dedica un capitolo alla programmazione in Python, un linguaggio emergente per la bioinformatica. Contiene inoltre numerosi link e riferimenti a risorse liberamente accessibili sul web, che permettono di utilizzare immediatamente molti dei metodi descritti.
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Informazioni
Indice dei contenuti
- Copertina
- Crediti
- Indice
- Prefazione
- Ringraziamenti
- Capitolo 1 - Introduzione
- Capitolo 2 - Introduzione alle basi di dati
- Capitolo 3 - Confronto di due sequenze
- Capitolo 4 - Matrici di punteggio
- Capitolo 5 - Ricerche in banche dati con singola sequenza
- Capitolo 6 - Allineamento multiplo di sequenze
- Capitolo 7 - Alberi filogenetici
- Capitolo 8 - Ricerche in banche dati con allineamenti multipli
- Capitolo 9 - Prevedere le proprietà strutturali delle proteine a partire dalle sequenze
- Capitolo 10 - Confronto tra strutture di proteine
- Capitolo 11 - Dalla sequenza alla struttura e alla funzione di una proteina
- Capitolo 12 - Meccanica e dinamica molecolare
- Capitolo 13 - La bioinformatica nella progettazione razionale di farmaci
- Appendice - Introduzione alla programmazione con Python
- Indice analitico