Bioinformatique avec Python et Biopython
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Bioinformatique avec Python et Biopython

  1. 219 pages
  2. French
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  4. Disponible sur iOS et Android
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Bioinformatique avec Python et Biopython

À propos de ce livre

La bioinformatique est une discipline essentielle de la biologie. Les domaines dits en omique (génomique, métagénomique, transcriptomique, protéomique, métabolomique…), compte-tenu de la très grande quantité et complexité des données biologiques à collecter et analyser, nécessitent des outils bioinformatiques.
Python, par sa simplicité d'apprentissage, est un langage particulièrement utilisé pour développer des applications.
Biopython est un ensemble d'outils, librement disponibles, permettant de développer des bibliothèques et des applications Python pour les besoins des travaux en bioinformatique.
Cet ouvrage construit sur le principe « une question de biologie, une réponse en programmation Python – Biopython  » permettra à l'étudiant en sciences de la vie d'appréhender différents aspects de la bioinformatique à travers le prisme de ces outils.
L'objectif principal de cet ouvrage est de comprendre la logique de ces scripts et d'établir un lien avec le concept biologique afférent afin que le lecteur puisse développer ses propres scripts ou adapter ceux existants.
Tous les scripts de l'ouvrage sont accessibles librement. 

Informations

Éditeur
Dunod
Année
2024
ISBN de l'eBook
9782100868629
Sujet
Sciences biologiques
Sujet
Biologie

Table des matières

  1. Bioinformatique avec Python et Biopython
  2. Table des matières
  3. Introduction
  4. Chapitre 1 Dénombrement des nucléotides et calculs associés (%GC, Tm)
  5. Chapitre 2 Écriture de séquences d’acides nucléiques
  6. Chapitre 3 Séquences et expressions régulières
  7. Chapitre 4 Recherches bibliographiques dans PubMed
  8. Chapitre 5 Profil d’une famille de protéines
  9. Chapitre 6 Profil d’hydrophobicité d’une protéine – fenêtre de taille variable
  10. Chapitre 7 Position de cystéines impliquées dans un pont disulfure
  11. Chapitre 8 Calcul du barycentre d’une chaîne polypeptidique repliée
  12. Chapitre 9 Diagrammes de Ramachandran
  13. Chapitre 10 Contacts entre résidus d’acides aminés dans les structures 3D
  14. Chapitre 11 Superposition de structures protéiques
  15. Chapitre 12 Les protéines ou régions intrinsèquement désordonnées
  16. Chapitre 13 Alignements de séquences et protéines homologues
  17. Réponses aux questions
  18. Annexes
  19. Index

Approuvé par les 375,005 étudiants

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