Après un séjour à Lourdes où il a assisté aux souffrances des malades et à l'inaction des religieux, l'abbé Pierre Froment décide d'écrire et de publier « La Rome nouvelle », un livre critique revendiquant un renouveau du catholicisme, et un retour aux valeurs originelles du christianisme.
Mais alors qu'il croyait défendre la vision du pape Léon XIII, son livre est mis à « l'Index ». L'abbé Pierre doit immédiatement partir à Rome afin de défendre son ouvrage et plaider sa cause face au pape. Cependant, il fait rapidement connaissance avec l'Église de Rome et ses violences intellectuelles…
Après un voyage à Rome et au Vatican, Zola érige un tableau sans concession du Pape et de son clergé. Il s'agit aussi d'une fresque psychologique d'un prêtre en proie aux doutes, et d'une remise en question de la religion catholique. Ce second tome des « Trois Villes » créé à sa sortie une polémique virulente.